加工貿易放棄保稅貨物，一般有變賣和銷毀等兩種方式，根據海關的規定，加工貿易企業因故無法內銷或退運，而申請放棄邊角料、剩餘料件、殘次品、副產品或受災的保稅貨物，憑企業放棄該批貨物的申請，和海關受理企業放棄貨物的有關單證，經海關核實無誤後，可以辦理核銷手續。
至於放棄的貨物有以下幾種情況：

一、經海關核定有使用價值時，由主管海關依海關法第30條第四款規定變賣處理。

二、經主管海關核定沒有使用價值時，由企業自行處理。

三、對按照規定須進行銷毀處理的情況下，由企業負責銷毀，海關憑有關銷毀證明材料辦理核銷手續。

2009年海關總署在「加工貿易放棄貨物的有關問題公告」中，則對保稅貨物的放棄進一步做出規定，其重點如下：
一、企業申請放棄加工貿易貨物，除按現行規定提交有關單證、材料外，還須提供經政府價格主管部門認定資質的價格評估機構，出具關於準備放棄的加工貿易貨物價值證明。

二、由海關按規定做變賣處理的加工貿易放棄貨物，企業應當在海關做出准予放棄之日起15日內，將加工貿易放棄貨物全部運至海關指定的倉庫。

三、按照規定需要進行銷毀處理的加工貿易放棄貨物，企業應當在實施銷毀三個工作日前，向主管海關報送銷毀方案，並自海關做出准予放棄之日起15日內，完成全部放棄貨物的銷毀工作。

四、企業完成加工貿易放棄貨物交接入庫、銷毀，或者經海關批准自行處理後五個工作日內，憑相關證明材料，辦理加工貿易放棄貨物的進口報關手續。

五、加工貿易放棄貨物的報關手續：
1. 加工貿易放棄貨物的報關方式，具體分為「料件放棄」和「成品放棄」兩種，如果是放棄半成品、殘次品或副產品，應按單耗關係折成料件，按「料件放棄」報關。

2. 加工貿易放棄貨物的報關價格，視企業放棄進口料件、半成品、殘次品還是副產品，按照或折成原進口料件價格申報；如果是放棄成品，則按照合同備案價格申報。

3. 加工貿易放棄貨物說明事項：企業放棄半成品、殘次品、副產品的，應在報關單備註欄註明「半成品」、「殘次品」、「副產品」等相關字樣；如果是銷毀處理，則企業應在報關單備註欄註明「銷毀」字樣；如果是經海關批准由企業自行處理，應在報關單備註欄註明「自行處理」字樣。

六、企業憑加工貿易放棄貨物的報關單，以及其他有關單證，向海關辦理放棄貨物的報核手續。

在實務操作中，企業申請放棄加工貿易貨物，須在手冊有效期內，向海關提交放棄貨物書面申請、「放棄聲明」、「移交放棄貨物、物品清單」及加工貿易手冊等，「移交放棄貨物、物品清單」上須列明放棄貨物的名稱、規格、數量、價值。

海 關對企業所提供的上述材料進行審核，並對放棄貨物下廠實地核查；符合海關規定，則在企業的「放棄聲明」和「移交放棄貨物、物品清單」上簽批意見。

最後，要特別留意的是，依海關總署規定，如果是國家禁止或限制進口的廢物，或是對環境造成污染的貨物，都不得聲明放棄。