「商標」或「專利」在大陸遭侵權時，台商常忽略可以採取刑事手段，也就是透過向公安局報案方式進行自我保護；另一方面，台商由於害怕配方或專有技術被公開而未申請專利，企業客戶名單或獨特管理方法等，也可能被第三方盜用或複製，這些情況和商標或專利遭侵權一樣，都可以透過所謂「侵犯商業秘密」的理由採取刑事手段，進一步向侵權方施壓。

這裡所謂的商業秘密，可分類為「技術」秘密和「經營」秘密兩大類，技術秘密是一種設計邏輯、工藝製造過程，不斷嘗試後得到以數字表現的經驗值，或產品配方，甚至一種技術上的訣竅，都可被稱為技術秘密；至於經營秘密，是指客戶名單、貨源情報、生產或銷售策略，甚至是工程界常見的招投標的標底或標書內容等資訊，都屬於經營秘密所必須保護的範圍。

實務中，會發生侵犯商業秘密的情況，常是合資股東拆夥後，分家出去的另一方股東沿用之前合資企業的商業秘密，最後遭到原合資企業的舉報；或離職員工拿著老東家的商業秘密運用在新工作單位上，被原來的老闆起訴；再不就是挖角競爭對手或同行員工，就算沒有真的侵犯商業秘密，也難逃瓜田李下的嫌疑。

不管是大陸「刑法」還是「反不正當競爭法」，針對侵犯商業秘密都有具體條文加以定義，但要以侵犯商業秘密向公安局報案，最終能說服公安局立案的關鍵，在於所提供的侵犯商業秘密證據是否充分，因為立案不易，大部分台商在處理侵犯商業秘密案件時，常先向法院以反不正當競爭為由提起民事訴訟，之後再由法院依職權移送公安局。

侵犯商業秘密是刑事責任，一旦在公安局立案成立，威力要遠大於法院的民事訴訟程序，因此有許多企業都以此作為傳統商業競爭外的另一個手段，甚至有企業在併購或行銷部門中直接配備法務人員，以侵犯商業秘密為由，逼迫不願被併購的一方就範，或以此理由打擊市場上的競爭對手。

為此，大陸各地公安局在受理侵犯商業秘密案件時的標準也就不斷提高，對於各項人證、物證的要求更多，目的就是為了怕企業以法律手段作為市場競爭的策略，因為就算經調查後沒有侵犯商業秘密的事實，還給被指控的一方清白，但被調查的企業往往在企業信譽或內部正常運作上，都已受到很大的傷害。

值得一提的是，因新員工所引發的侵犯商業秘密問題逐年攀升，常見的冤枉情況是，新招聘員工帶進前公司的技術、經驗，甚至客戶名單、供應商上下游關係等，會不會被認定為侵犯商業秘密，實務中是見仁見智，因不同執法人員、不同情況下，會有完全不同的見解，台商人事部門應先做好這部分的內控，最起碼在企業內部不能有員工之前任職公司的任何書面資料或電子檔案，否則一旦遭調查，就是人贓俱獲。