個人股東股權轉讓利得是否課稅，主要還是與投資公司的性質有關，其重點如下：

一、若投資標的為有限公司，或是股份有限公司但未簽證發行股票
依據《證券交易稅條例》規定，「有價證券」是指各級政府發行的債券、公司發行的股票、公司債及經政府核准得以公開募銷的其他有價證券。其中「公司」係指符合《證券交易法》第4條及《公司法》第156條規定的「股份有限公司」。故若股東投資的是「有限公司」，當其出售有限公司之出資額、股單或其他憑證時，因非屬《證券交易稅條例》第1條所指的有價證券，故免徵千分之三的證券交易稅；但股權交易所得需視為《所得稅法》第14條規定的財產交易所得，而其股權轉讓價格超過原始出資額部分，應合併於當年度其他各類所得課徵綜所稅。

若股東投資的是「股份有限公司」，但該公司並未依《公司法》第162條規定，經主管機關或其核定發行登記機構（多為銀行）簽證後發行股票，即使公司自製股票給股東，或是轉讓時出具股份轉讓證書或股份過戶書，皆非屬《證券交易稅條例》第1條所指的有價證券，故當股東轉讓持股時，免徵千分之三的證交稅，但股權交易所得視同為財產交易所得，需合併於其他各類所得課徵綜所稅，稅負與出售有限公司股權相同。

二、若投資標的為股份有限公司並依法簽證發行股票，但非上市（興）櫃公司
若投資標的為股份有限公司，且已依《公司法》第162條規定簽證發行股票，該股票即屬《證券交易稅條例》所規定的有價證券，故股東轉讓持股時，應依每次成交價格的千分之三課徵證交稅，並適用《所得稅法》4-1條規定停徵證券交易所得稅。但若被投資公司並非上市（興）公司，則股權交易所得尚需依《所得基本稅額條例》第12條規定，納入個人基本所得稅額計算，當個人基本所得稅額大於一般所得稅額時需補繳差額。

三、若投資標的為股份有限公司並依法簽證發行股票，且為上市（興）櫃公司
若股東投資的是上市（興）櫃公司，其已依法公開發行股票，當然適用《證券交易法》及《證券交易稅條例》規定，於股東轉讓持股時課徵千分之三的證交稅，但停徵證券交易所得稅。另依《所得基本稅額條例》規定，上市（興）櫃公司股票的交易所得，並不在基本稅額的課稅範圍內，故股票交易所得無須納入個人基本所得稅額計算。

綜上所述，個人股東轉讓台灣股權投資之交易所得課不課稅？應以出售的投資標的性質判斷，若買賣股份有限公司未發行股票之股份、未依法簽證之股票、或有限公司之股單，則交易所得需合併於其他所得課徵所得稅，但無須繳交千分之三的證交稅；若買賣有發行股票但非屬上市(興)櫃公司的股份時，除了繳交千分之三的證交稅，尚須將交易所得計入個人基本所得額計算；若買賣上市(興)櫃公司股票則僅需繳交證券交易稅即可，並無其他所得稅負。因此，股東轉讓股份時，應先向發行公司確認是否為依《公司法》第162條規定簽證發行股票，以免適用法令錯誤而短漏報所得，事後遭稽徵機關補稅及裁罰。